Про сложность и избыточность
Oct. 10th, 2013 04:53 pm![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png)
Мне кажется, что молекулярно-генетические статьи в Science и Nature становятся все более неудобочитаемыми (или это возрастное)? Причем про другие, менее пафосные журналы я этого не скажу. А в Науке и Природе такая борьба идет за каждую букву, редакторы так стараются утрамбовать максимум информации в минимум слов, что в итоге получается текст нечеловеческий, текст без всякой избыточности, хуже телеграфного, текст, для понимания которого требуется нехилая квалификация, куча сил и крепкое здоровье.
Но в итоге когда все-таки удается более-менее понять, что же, черт побери, написано в этой ужасной статье, возникает некое чувство победы.
Ну а может, сейчас самые модные темы в мол. биологии действительно становятся настолько сложными, что это вопрос содержания, а не стиля. В конце концов, я уже два или три раза получал отклики от авторов, что, дескать, прочитав вашу заметку на "Элементах" по моей статье, я сам стал лучше понимать, чем же я, собственно, занимаюсь :) Это, конечно, помогает мне верить, что моя деятельность не является полностью вторичной и паразитической.
Вот очередная новость:
Конфликт между копиями удвоившегося гена ведет к избыточному усложнению генно-регуляторных сетей
Читать полностью
Там наглядно показано, что усложнение (в данном случае - усложнение системы регуляции активности генов) может в ходе эволюции происходить не потому, что это зачем-то нужно, а просто как побочное следствие случайной генной дупликации (через ряд последовательных закономерных шагов). То есть, короче говоря, никому это усложнение не нужно было, все отлично жили без него, но просто вот так случайно получилось. Рождается избыточная сложность. Сложность не для чего-то, а просто так.
А мы потом голову ломаем: зачем же в клетке всё так хитро, сложно и премудро устроено. Мировоззренчески важная работа :)
P.S. Число читателей этого блога перевалило за 5000. Новоподписавшихся хочу предупредить: я не занимаюсь взаимофрендом и пишу здесь только то, что самому интересно.
Но в итоге когда все-таки удается более-менее понять, что же, черт побери, написано в этой ужасной статье, возникает некое чувство победы.
Ну а может, сейчас самые модные темы в мол. биологии действительно становятся настолько сложными, что это вопрос содержания, а не стиля. В конце концов, я уже два или три раза получал отклики от авторов, что, дескать, прочитав вашу заметку на "Элементах" по моей статье, я сам стал лучше понимать, чем же я, собственно, занимаюсь :) Это, конечно, помогает мне верить, что моя деятельность не является полностью вторичной и паразитической.
Вот очередная новость:
Конфликт между копиями удвоившегося гена ведет к избыточному усложнению генно-регуляторных сетей
Читать полностью
Там наглядно показано, что усложнение (в данном случае - усложнение системы регуляции активности генов) может в ходе эволюции происходить не потому, что это зачем-то нужно, а просто как побочное следствие случайной генной дупликации (через ряд последовательных закономерных шагов). То есть, короче говоря, никому это усложнение не нужно было, все отлично жили без него, но просто вот так случайно получилось. Рождается избыточная сложность. Сложность не для чего-то, а просто так.
А мы потом голову ломаем: зачем же в клетке всё так хитро, сложно и премудро устроено. Мировоззренчески важная работа :)
P.S. Число читателей этого блога перевалило за 5000. Новоподписавшихся хочу предупредить: я не занимаюсь взаимофрендом и пишу здесь только то, что самому интересно.
no subject
Date: 2013-10-10 12:59 pm (UTC)Вы пишИте, пожалуйста, во многих статьях даже до первичного понимания донырнуть сложно, нам без Вас - никак... интересующимся...
no subject
Date: 2013-10-10 01:01 pm (UTC)Когда лет так 80 назад это произошло в физике (а в математике так и того раньше) - это ведь никого не удивило!
no subject
Date: 2013-10-10 02:00 pm (UTC)Аналогично (с другими периодами времени) можно сказать и про математику, да и ряд других областей науки, скорее всего тоже через такие скачки «ой ужас — а нет, приемлемо — да всё же достаточно банально» проходили. Просто подошла очередь очередного скачка в биологии-генетике.
no subject
Date: 2013-10-10 02:06 pm (UTC)Ой! Здорово!
Напишите на досуге книжку "Квантовая электродинамика для инженеров" - кучу денег заработаете! :-)
no subject
Date: 2013-10-11 03:04 am (UTC)Математика — рутинная.
Если инженер не понимает этой математики, — значит он плохой инженер.
P.S.
Немного стебусь, конечно.
Но если сравнивать действительно достаточно привычную математику, вписывающуюся в стандартнейшие курсы, что используется для квантовой физики всех сортов (кроме квантовой равитации, разве что) и матаппарат теории струн… То, что инженерам та математика оказалась недоступна, — это недостаток их математической подготовки, безбожно отставшей.
no subject
Date: 2013-10-12 11:26 am (UTC)no subject
Date: 2013-10-10 08:06 pm (UTC)no subject
Date: 2013-10-10 01:02 pm (UTC)no subject
Date: 2013-10-10 01:14 pm (UTC)no subject
Date: 2013-10-11 07:57 am (UTC)no subject
Date: 2013-10-11 08:38 am (UTC)no subject
Date: 2013-10-10 01:14 pm (UTC)объяснения нужны! я на лекцию прихожу и за три часа, порой, понимаю больше, чем за неделю читания. хотя, идеальный баланс это все-таки лекции в дополнение к прочитанному, а не вместо него =)
no subject
Date: 2013-10-10 01:50 pm (UTC)Предполагаю, что такая конкуренция между дуплицированными генами возникает не всегда. Если фактор транскрипции, то он как камень сверху горы. Включился и целую лавину за собой тянет. Если какой ген в самом низу иерархии дуплицируется, то событие может вообще пройти незамеченным.
no subject
Date: 2013-10-11 08:01 am (UTC)Так вы же специалист. А каково бедным палеонтологам?
Впрочем, теперь в тех же самых журналах печатают и популярные пересказы самых важных статей.
no subject
Date: 2013-10-11 08:05 am (UTC)no subject
Date: 2013-10-12 08:46 am (UTC)no subject
Date: 2013-10-10 01:58 pm (UTC)деятельность полезная и интересная!
кстати, выбор 'что именно пересказать, на что обратить внимание' - это тоже существенная работа.
no subject
Date: 2013-10-12 11:43 am (UTC)С удовольствием читаю книги автора блога: очень хорошо выдержан баланс.
Написано языком, доступным для непрофессионалов, но при этом нет даже намека на желтизну.
no subject
Date: 2013-10-10 02:38 pm (UTC)no subject
Date: 2013-10-10 03:07 pm (UTC)так они же в этих наших интернетах публикуются, какая там та разница есть лишняя буква или нету?
no subject
Date: 2013-10-10 03:12 pm (UTC)Я прошу прощения, но мне казалось, что это самоочевидная мысль, которую и доказывать-то специально не нужно. О_о
Отличную аналогию можно провести с информационными системами, разрабатываемыми десятилетиями - чем больше в них появляется функций (которые зачем-то таки нужны), тем сложнее и запутаннее становится структура(как побочное явление, просто потому что для сложной софтины менее трудозатратно писать все новые и новые костыли, чем создавать ее с нуля).
no subject
Date: 2013-10-11 06:39 am (UTC)no subject
Date: 2013-10-12 11:49 am (UTC)Думаю, что в природе оно все также устроено.
no subject
Date: 2013-10-10 03:15 pm (UTC)Поздравляю, Александр, вы теперь как Арарат и Казбек - пятитысячник ))
Ваша просветительская деятельность, в т.ч. на "Элементах", одна из самых ярких и заметных в России. Так что ждем и дальнейших от вас переводов с птичьего на русский - здорово вправляют мозги.
no subject
Date: 2013-10-10 03:51 pm (UTC)Конфликт между копиями удвоившихся учёных ведёт к избыточному усложнению научно-регуляторных сетей.
no subject
Date: 2013-10-10 04:25 pm (UTC)Беда в другом: не скажу за биологию, но в некоторых других сферах науки создается впечатление, что исследователи прямо таки нарочно излагают свои мысли максимально сложно для восприятия. Очевидно для того, чтобы они выглядели более наукообразными..
Про сложность и избыточность
Date: 2013-10-10 05:49 pm (UTC)no subject
Date: 2013-10-10 06:21 pm (UTC)no subject
Date: 2013-10-11 07:54 am (UTC)Про новый специализированный регуляторный белок Arg80, о котором речь в статье, вроде бы нельзя такого сказать, поскольку дрожжи растут с предковым неразделенным белком не хуже, чем с двумя современными специализированными. Конечно, может быть, в природных условиях, в отличие от лабораторных, два специализированных белка чем-то лучше, чем один предковый белок-генералист. Но мы этого не знаем, а главное, показана принципиальная возможность усложнения даже в том случае, если приспособленность после усложнения оказывается не выше, чем до него.
no subject
Date: 2013-10-10 10:17 pm (UTC)no subject
Date: 2013-10-10 10:19 pm (UTC)Ссылки
Date: 2013-10-11 05:01 am (UTC)no subject
Date: 2013-10-11 07:57 am (UTC)no subject
Date: 2013-10-11 09:01 am (UTC)это как 200кмч па нашим дарогам- камута низзя, а камута и 250 -мала!
функции нада апридилять - и условея
толька тагда и ришать вапрос - эсбыточное или нидастатачное "услажнение" - в кантексте зодач
Несколько интересных и полезных тем
Date: 2013-10-11 10:18 am (UTC)Ссылки
Date: 2013-10-11 02:57 pm (UTC)Ссылки
Date: 2013-10-12 12:00 am (UTC)no subject
Date: 2013-10-12 01:10 am (UTC)Саша, прими еще один идентичный)). По ссылке идется на сайт элементов со статьями 2011 года. Почему?
no subject
Date: 2013-10-12 08:51 am (UTC)Насчет ссылки: это сайт "Элементы" барахлит, надеюсь, временно.
no subject
Date: 2013-10-12 01:30 pm (UTC)no subject
Date: 2013-11-03 08:31 pm (UTC)С уважением,
Эли Шкроб