macroevolution: (Парантроп)
[personal profile] macroevolution
Готовимся к семинару 10 декабря, посвященному критике эпигенетической теории эволюции (ЭТЭ). По замыслу, сначала я должен выступить с 20-минутным "вступительным словом", максимально умиротворительным. Затем - основной доклад А.Н.Кузнецова с суровой критикой. В ходе подготовки "вступительного слова" получился громоздкий текст, который целиком зачитывать на семинаре нельзя - это заняло бы не 20 минут, а целый час, если не больше. Поэтому я вывесил его в сеть для предварительного ознакомления, а на семинаре скажу только про бацилл и в сверхсжатой тезисной форме - все остальное. Разумеется, это не какая-то там законченная лекция, это весьма разрозненные соображения, правда, очень многословные.
В поисках подтверждений эпигенетической теории эволюции (ЭТЭ).

UPD. ОБРАЩЕНИЕ К КОЛЛЕГАМ - НАУЧНЫМ ЖУРНАЛИСТАМ.
Мы тут получили множество просьб от людей, которые не смогут прийти на семинар, чтобы была стенограмма или хоть что-то. Всем интересно. См. напр., обсуждение у К.Ю.Еськова. Может это и не такой хит будет, как диспут Кювье с Сент-Илером :), но все же. Не откомандирует ли кто-нибудь на семинар корреспондента-другого, а?
Page 2 of 3 << [1] [2] [3] >>
From: [identity profile] e-samusenko.livejournal.com
Ну кому как. Мне - не важно.
Смысл в том, что все работы были в свое время признаны и сомнения не вызывали.
Время было сложным, поэтому и ветви пошли в разные стороны.

Эйнштейн в момент публикации своей работы - был служащим патентного бюро.
From: [identity profile] macroevolution.livejournal.com
Ой, мамочки! Креатрон... Кажется, это как раз то самое, в случае открытия чего мы с Докинзом обещали съесть свои шляпы? :-)
From: [identity profile] e-samusenko.livejournal.com
Да ладно, я не о креатроне, а о тренде. Пути могут быть разные, но вектор поиска вполне определился.

Специально подчеркнул, что А.М. категорически не отождествляет себя с ЭТЭ.
Edited Date: 2010-12-08 06:03 pm (UTC)

Date: 2010-12-08 06:43 pm (UTC)
From: [identity profile] abba65.livejournal.com
И как же на такой тест отвечать??
"Ни в одном календаре такого быть не может!" (с)

Часть 4. К.Северинов

Date: 2010-12-08 07:10 pm (UTC)
From: [identity profile] e-samusenko.livejournal.com
Чем же заменяют ЭТЭ на западе, не имея представления о ней, зная только об эффекте Болдуина?

«НАСЛЕДСТВЕННОСТЬ У БАКТЕРИЙ: ОТ ЛАМАРКА К ДАРВИНУ И ОБРАТНО»
Лекция д.б.н., зав. лаб. Института молекулярной генетики РАН, профессора Университета Ратгерса (США) Константина Северинова
25 марта 2010 года в Политехническом музее.

«Джон Кернс — это один из крупнейших исследователей ранней молекулярной биологии, связанной с изучением бактерий и их вирусов. Джон Кернс опубликовал в конце 80-х годов в журнале “Nature” статью, которая называлась “О природе мутаций”. Своей статьей Кернс вызвал большой переполох.
Селекция, которая производилась в опытах Кернса, по-научному называется селекцией в условиях стресса. Оказывается, что стресс, в нашем случае это голодание, вызывает гипермутабельность. .... Надо понимать, что это ненаправленный, т.е., дарвиновский процесс, в ходе которого увеличивается количество всех мутаций. Но из получающейся более разношерстной популяции можно-таки будет выбрать несколько ребят, которые стали такими, как нужно. Это первый механизм возникновения “адаптивных” кернсовских мутаций» К.Северинов

Как же выглядит оригинальный опубликованный Кернсом текст?
Д. Кэрнс и др. ПРОИСХОЖДЕНИЕ МУТАНТОВ. NATURE vol. 335 8 September 1988, стр.145
1988!!!!!! Год.

«ОСНОВНАЯ ЦЕЛЬ ДАННОЙ СТАТЬИ – ПОКАЗАТЬ, НАСКОЛЬКО СОМНИТЕЛЬНА НАША ВЕРА В СПОНТАННОСТЬ (СЛУЧАЙНОСТЬ) БОЛЬШИНСТВА МУТАЦИЙ. Этот взгляд выглядит как доктрина, никогда, должным образом, не проверенная на практике. Здесь мы описываем несколько экспериментов и некоторые косвенные доказательства, указывающие на то, что бактерии могут выбирать, какого рода мутации им следует получить. Но мы понимаем, что этот вопрос слишком важен, чтобы его можно было разрешить в результате трёх-четырёх неоднозначных экспериментов.
нестабильность геномов может возникать под воздействием стресса и исчезать после его окончания» Д. Кэрнс.
«Каждый из этих процессов дает отдельным клеткам возможность подвергать субпопуляцию их информационных макромолекул действию сил естественного отбора. КАЖДЫЙ ИЗ ЭТИХ ПРОЦЕССОВ МОЖЕТ ЛЕЖАТЬ В ОСНОВЕ МЕХАНИЗМА НАСЛЕДОВАНИЯ ПРИОБРЕТЁННЫХ СВОЙСТВ» Д. Кэрнс.

Выделено мною.

Так что возврат к Ламарку и Кернс – его новый пророк? Совсем нет – речь не о ламаркизме, но у Кернса не хватает терминов, чтобы подчеркнуть дарвинистскую суть этого наследования: «модификацию генотипа». Кто бы ему рассказал о работах Шмальзаезена.

Идем дальше.
«Сейчас я рассажу в третий раз об эксперименте по селекции бактериальных мутантов. Этот эксперимент делали два ученых из DANISCO, Р. Барангу и Ф. Хорват.....Они отбирали мутации устойчивости к бактериофагу у разных штаммов Streptococcus thermophilus....
Т.е. механизм совершенно ламарковский: приобретение признаков при изменении условий окружающей среды. ОН ДРУГИМ И НЕ МОЖЕТ БЫТЬ, потому что изменяющаяся среда в виде вируса и является источником информации о том, как с этим изменением бороться». К.Северинов. Выделено мною.

МЕХАНИЗМ МОЖЕТ БЫТЬ ДРУГИМ! СЕВЕРИНОВ НЕ ПРАВ! КАКИМ – «МОДИФИКАЦИЯ ГЕНОТИПА» (ЭТЭ).

А теперь обратим внимание на дату публикации описанного Севериновым открытия «ламарковского механизма»:
CRISPR/Cas, the Immune System of Bacteria and Archaea. Science 8 January 2010: Vol.327.no.5962,pp.167–170
8 января 2010 года.
Сравним с датой публикации статьи Оловникова о необходимости существования «модификации генотипа» - 12 2009.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЕ ДОКАЗАТЕЛЬСТВО ВОЗМОЖНОСТИ СУЩЕСТВОВАНИЯ «МОДИФИКАЦИИ ГЕНОТИПА» БЫЛО ОПУБЛИКОВАНО ЧЕРЕЗ ПОЛ МЕСЯЦА ПОСЛЕ ПУБЛИКАЦИИ НАУЧНОЙ ТЕОРЕТИЧЕСКОЙ СТАТЬИ О НЕОБХОДИМОСТИ И ПОТРЕБНОСТИ В ТАКОЙ МОДИФИКАЦИИ.
Совершенно не важно, на данном этапе, с помощью какого именно механизма.

«Теперь мы знаем, что ламарковский механизм наследственности есть, но это никоим образом не привело к перечеркиванию данных о существовании дарвиновского механизма, в реальности которого нет никаких сомнений. Просто, наше понимание жизни стало более полным» К.Северинов.

А ВОТ ТЕПЕРЬ ПОСЛУШАЕМ, ЧТО «ПЛОХОГО» НАМ СКАЖЕТ ОБ ЭТЭ А.Н.КУЗНЕЦОВ, как предполагает Александр.
From: [identity profile] pogorily.livejournal.com
>Смысл в том, что все работы были в свое время признаны и сомнения не вызывали.

Ну и что? Все течет, все изменяется, ранее признанные теории с накоплением новой информации сплошь и рядом приходится подвергать модификации.
Тем более в биологии, которая и по сей день не вышла еще из состояния "бури и натиска", когда новые факты стремительно накапливаются и о создании всеобъемлющих теорий говорить еще рано.

>Эйнштейн в момент публикации своей работы - был служащим патентного бюро.

Не работы, а работ. Он работал в нескольких областях физики.
Но действительно, основные результаты им были получены в период работы в патентном бюро, когда он был "никто и звать никак". А слава и известность, как это нередко бывает в физике и математике, пришла уже к бывшему ученому.
From: [identity profile] e-samusenko.livejournal.com
А при чем здесь ЭТЭ?

Date: 2010-12-08 07:21 pm (UTC)
From: [identity profile] anisus.livejournal.com
я позволю себе не согласится с п 2 в тексте Вашего доклада:
"Эта мутация неким вполне определенным образом проявляется в фенотипе, то есть меняет строение, физиологию или поведение организма."

Вот две цитаты из работы Шишкина (1988):

"т. е. что возможности реализации любого мутантного генома не выходят за пределы, доступные его «нормальным» вариантам. Другими словами, все зиготы одного вида должны иметь одно и то же потенциальное пространство возможностей развития и различаются лишь по относительной вероятности их осуществления"

"Поэтому возникновение такой системы невозможно приписать элементарным мутациям. Элементарные воздействия на эту систему либо забуфериваются ею, либо меняют в ней выбор реализуемой онтогенетической траектории, но они не способны изменить исторически сложившуюся структуру самой системы."

Т.е. в принципе мутация согласно данному автору не привносит ничего нового в фенотип - ничего такого чего не было бы до неё.

Re: Часть 4. К.Северинов

Date: 2010-12-08 07:22 pm (UTC)
From: [identity profile] macroevolution.livejournal.com
Что-то вы всё как-то в кучу свалили. "Адаптивное мутирование" Кернса от 1988 г уже опровергнуто, кстати. См. коммент Кунина тут: http://macroevolution.livejournal.com/43138.html
Так что осторожнее надо.
А CRISPR - это самое близкое приближение к ламарковскому наследованию, которое известно на сегодняшний день. И оно-то возможно лишь потому, что информация, вписываемая в геном, уже изначально записана на языке ДНК (это фрагмент ДНК вируса). А механизма, переписывающего какую-то иную информацию на язык ДНК, не существует.
Тут опасно перегибать палку, это добром не кончается.
Кстати, сами стронники ЭТЭ очень энергично открещиваются от ламаркизма и не терпят, когда их сравнивают с ламаркистами.

Date: 2010-12-08 07:25 pm (UTC)
From: [identity profile] macroevolution.livejournal.com
Так это я описываю классическую модель, а не шишкинскую. А Шишкин, ясное дело, с ней не согласен. Шишкинская модель описывается ниже. Это вы не очень внимательно прочли.

Re: Часть 4. К.Северинов

Date: 2010-12-08 07:33 pm (UTC)
From: [identity profile] e-samusenko.livejournal.com
По поводу Кернса и CRISPR это не ко мне, а к Северинову. Я не биолог и не комментирую его лекцию.

Где Вы видели сторонников ЭТЭ? Тут еще кто-то ее защищает? Я остался один!!!!
Я пять раз открестился от ламаркизма, даже не поддрежав Северинова в легкости использования определений. Значит я истинно верующий в ЭТЭ?:-)

Re: Часть 4. К.Северинов

Date: 2010-12-08 07:37 pm (UTC)
From: [identity profile] e-samusenko.livejournal.com
См. коммент Кунина тут: http://macroevolution.livejournal.com/43138.html

О Кернсе нет ничего.

По теме обсуждения

Date: 2010-12-08 07:58 pm (UTC)
From: [identity profile] pogorily.livejournal.com
Присоединяюсь к предложению упомянуть в выступлении эффект Болдуина, причем в терминах "входит в мэйнстрим" а не "дополняет мэйнстрим". Так мысль лучше доходит.

Date: 2010-12-08 08:05 pm (UTC)
From: [identity profile] anisus.livejournal.com
Если не секрет то кто же тогда среди приверженцев ЭТЭ высказывает идеи сформулированные Вам в начале поста?
Ранее я думал что вся ЭТЭ базируются преимущественно на Шишкине....

Date: 2010-12-08 09:09 pm (UTC)
From: [identity profile] macroevolution.livejournal.com
В начале - не модель ЭТЭ, а традиционные классические взгляды, с которыми ЭТЭ не согласна. Там написано "Простейшие эволюционные модели обычно предполагают, " Имеются в виду традиционные, не ЭТЭшные взгляды.

Date: 2010-12-08 09:19 pm (UTC)
From: [identity profile] anisus.livejournal.com
ясно, спасибо за разъяснения! Мне казалось что имеются ввиду "простейшие эволюционные модели" именно в рамках ЭТЭ.

Date: 2010-12-08 09:27 pm (UTC)
From: [identity profile] clayrat.livejournal.com
> Но две нужные мутации не могут появиться одновременно. Тут-то и приходит на помощь механизм дестабилизации онтогенеза.

чем-то похоже на ленивые вычисления

Шишкин

Date: 2010-12-08 09:58 pm (UTC)
From: [identity profile] awfulpasha.livejournal.com
Теория Шишкина в вашем кратком изложении мало отличается от традиционной. Первые два пункта можно вычеркнуть (и получить тем самым традиционную теорию), поскольку все равно ведь не постулируется непосредственного влияния фенотипа на генотип. Влияние этой эпигенетической надстройки выглядит нелогичным и непроверяемым.
Единственным ценным соображением кажется акцент на онтогенезе как субстрате отбора.
Буду благодарен, если укажете, в чем ошибка. Не биолог, готов глубоко заблуждаться.

Re: Шишкин

Date: 2010-12-09 08:46 am (UTC)
From: [identity profile] macroevolution.livejournal.com
Я сам примерно как-то так и думаю. Поэтому на ошибку указать не могу. А вот Шишкин бы непременно указал. Но это уже из области философии и психологии. Одни люди более других склонны усматривать везде контрасты и противоречия.

Date: 2010-12-09 10:03 am (UTC)
From: [identity profile] misha-makferson.livejournal.com
А сколько вариантов ответа? :-)

Date: 2010-12-09 10:07 am (UTC)
From: [identity profile] barson.livejournal.com
Не понял вопрос. Варианты ответа я привёл. Правильный из них по условию один.

Date: 2010-12-10 01:58 am (UTC)
From: [identity profile] ashipunov.livejournal.com
Вы не могли бы выяснить у докладчика -- что предложить почитать по ЭТЭ англоязычным биологам? Поиск типа http://scholar.google.com/scholar?sourceid=Mozilla-search&q=epigenetic+theory+of+evolution ничего не дает...
===
С уважением,
А. Шипунов

Date: 2010-12-10 08:03 am (UTC)
From: [identity profile] macroevolution.livejournal.com
В статье Шишкина 2005 г. в "онтогенезе" есть две ссылки на его англоязычные публикации:
Shishkin M.A. The development of the evolutionary theory.
Some lessons // Rivista di Biologia. 1989. V. 82. P. 323-325.
Shishkin M.A. Evolution as a maintenance of ontogenetic stability
// Acta Zool. Fennica. 1992. V. 191. P. 37^2.

Date: 2010-12-10 10:11 am (UTC)
From: [identity profile] ashipunov.livejournal.com
Спасибо. Понятно. Увы. Хотелось бы чего-нибудь доступного и не двадцатилетней давности. Да и ЭТЭ сформулирована в целом позже. Нашлось, на самом деле нечто -- http://www.springerlink.com/content/w536m561308nn776/ , но, судя по всему, там нет положений теории, а есть нечто "вообще".
Может быть, все-таки спрОсите?
Page 2 of 3 << [1] [2] [3] >>

January 2019

S M T W T F S
  12345
6789101112
1314 1516171819
20212223242526
2728293031  

Page Summary

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Feb. 8th, 2026 10:10 am
Powered by Dreamwidth Studios