Еще один шаг к воссозданию мира РНК
Apr. 13th, 2011 08:06 pm![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
macroevolution Наконец-то удалось сделать относительно приличный рибозим с РНК-полимеразной активностью:
Рибозимы могут размножать друг друга
В дополнение к тому, что сказано в заметке. Там самая хорошая новость даже не в том, что получен рибозим, способный скопировать кусочек РНК длиной до 95 нуклеотидов, и не в том, что его эффективность теперь не так сильно зависит от нуклеотидной последовательности копируемой матрицы, и не в том, что точность репликации выросла в 20 раз по сравнению с прежними достижениями. Самое главное - разработаны отличные новые методы, которые позволяют эффективно осуществлять "искусственную эволюцию" рибозимов-полимераз. Теперь дело может пойти на лад. В частности, давно предполагалось, что где-то в "пространстве последовательностей" могут существовать очень короткие эффективные рибозимы-полимеразы. И новые методики вроде как снимают те технические трудности, из-за которых до сих пор нельзя было всерьез приступить к поиску таких рибозимов.
А еще выяснилась такая интересная фишка: новый рибозим, который вывелся в ходе искусственной эволюции, копирует только матрицы, содержащие определенную короткую последовательность нуклеотидов - как бы "метку", по которой он узнает матрицу, которую надо копировать. Система, как пишут, похожа на то, как рибосомные РНК работают с мРНК при трансляции. В связи с этим появляются такие смутные мысли: что, если в РНК-мире функции РНК-полимераз на самом деле выполняли какие-то комплексы из нескольких РНК, напоминающие рибосомы? Что, если трансляция некоторым образом произошла от рибозимной репликации РНК?
P.S. Я сдал рукопись в издательство, занимаюсь теперь добычей иллюстраций и вот, начинаю наверстывать "долги" по новостям )
Рибозимы могут размножать друг друга
В дополнение к тому, что сказано в заметке. Там самая хорошая новость даже не в том, что получен рибозим, способный скопировать кусочек РНК длиной до 95 нуклеотидов, и не в том, что его эффективность теперь не так сильно зависит от нуклеотидной последовательности копируемой матрицы, и не в том, что точность репликации выросла в 20 раз по сравнению с прежними достижениями. Самое главное - разработаны отличные новые методы, которые позволяют эффективно осуществлять "искусственную эволюцию" рибозимов-полимераз. Теперь дело может пойти на лад. В частности, давно предполагалось, что где-то в "пространстве последовательностей" могут существовать очень короткие эффективные рибозимы-полимеразы. И новые методики вроде как снимают те технические трудности, из-за которых до сих пор нельзя было всерьез приступить к поиску таких рибозимов.
А еще выяснилась такая интересная фишка: новый рибозим, который вывелся в ходе искусственной эволюции, копирует только матрицы, содержащие определенную короткую последовательность нуклеотидов - как бы "метку", по которой он узнает матрицу, которую надо копировать. Система, как пишут, похожа на то, как рибосомные РНК работают с мРНК при трансляции. В связи с этим появляются такие смутные мысли: что, если в РНК-мире функции РНК-полимераз на самом деле выполняли какие-то комплексы из нескольких РНК, напоминающие рибосомы? Что, если трансляция некоторым образом произошла от рибозимной репликации РНК?
P.S. Я сдал рукопись в издательство, занимаюсь теперь добычей иллюстраций и вот, начинаю наверстывать "долги" по новостям )
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2011-04-13 04:16 pm (UTC)no subject
Date: 2011-04-13 04:25 pm (UTC)no subject
Date: 2011-04-13 04:41 pm (UTC)Скоро точно придется делать дополненное издание РС
no subject
Date: 2011-04-14 07:49 am (UTC)no subject
Date: 2011-04-14 08:01 am (UTC)no subject
Date: 2011-04-13 04:53 pm (UTC)no subject
Date: 2011-04-13 05:06 pm (UTC)no subject
Date: 2011-04-14 07:49 am (UTC)no subject
Date: 2011-04-13 06:30 pm (UTC)Что касается возможного происхождения трансляции от рибозимной репликации, наверное, было бы интересно поэкспериментировать с наиболее консервативными участками рРНК, какие у них перспективы в плане формирования различных структур с возможностями репликации полинуклеотидных цепочек.
no subject
Date: 2011-04-14 07:50 am (UTC)no subject
Date: 2011-04-13 06:51 pm (UTC)А завтра, если священная порка на студии не затянется, надеемся доехать таки до Винзавода.
no subject
Date: 2011-04-14 07:51 am (UTC)no subject
Date: 2011-04-14 08:00 am (UTC)no subject
Date: 2011-04-14 08:20 am (UTC)no subject
Date: 2011-04-14 08:49 am (UTC)там и картинка, и к ней разъяснение))
no subject
Date: 2011-04-14 09:03 am (UTC)no subject
Date: 2011-04-14 09:15 am (UTC)Только есть одно но: где и как его покажут и покажут ли вообще - пока неведомо, а в жж выложить - продюсер поймает и жужжалку оторвет. Предыдущий наш проект, http://oldodik.livejournal.com/9461.html
так и завис где-то - и ни себе ни людям.
no subject
Date: 2011-08-08 05:16 am (UTC)no subject
Date: 2011-08-08 06:59 am (UTC)no subject
Date: 2011-08-08 07:01 am (UTC)no subject
Date: 2011-08-08 07:23 am (UTC)Совершенно замечательные видео и аудиозаписи лекций, включая лекции Тимофеева-Ресовского. Блин, мне вот сейчас другими насущными делами надо заниматься, а я вот сижу смотрю и слушаю...
no subject
Date: 2011-08-08 07:27 am (UTC)no subject
Date: 2011-08-08 07:53 am (UTC)no subject
Date: 2011-08-08 07:59 am (UTC)no subject
Date: 2011-08-08 08:21 am (UTC)no subject
Date: 2011-08-08 08:28 am (UTC)Опробовать же его на подмосковном сравнительно новом декстопе нет возможности - мне меняли блок питания и что-то намудрили с портами, и они эту флэшку видеть не хотят. Причем это еще самый работоспособный вариант, мои перепробовали практически все - и практически все работало еще хуже.
no subject
Date: 2011-08-08 09:02 am (UTC)no subject
Date: 2011-08-08 09:05 am (UTC)И народ простит, я думаю, да и хозяин не погонит. Он троллей гоняет железной метелкой, а мы ж не троллим, а очень мирно пооффтопили.
no subject
Date: 2011-08-08 09:34 am (UTC)no subject
Date: 2011-08-08 07:28 am (UTC)no subject
Date: 2011-04-14 03:56 am (UTC)Тут нужно выделять курсивом не произошла, а некоторым образом :)
no subject
Date: 2011-04-14 07:52 am (UTC)no subject
Date: 2011-04-14 08:05 am (UTC)no subject
Date: 2011-04-14 08:19 am (UTC)no subject
Date: 2011-04-14 08:46 am (UTC)no subject
Date: 2011-04-14 09:00 am (UTC)no subject
Date: 2011-04-14 07:35 pm (UTC)2) ура!
PS надо бы договориться насчет лекции в нашей школе, помните?)
no subject
Date: 2011-04-15 08:52 pm (UTC)no subject
Date: 2011-04-15 08:53 pm (UTC)no subject
Date: 2011-04-15 09:04 pm (UTC)Вы мне можете написать по мейлу? markov_a(sobaka)inbox.ru