Удаление точек начала репликации ускоряет репликацию

[macroevolution]

Замечательное исследование, некоторым образом проливающее свет на происхождение механизмов репликации ДНК
Спасибо progenes за наводку и всем коллегам, приславшим pdf! )

Альтернативный способ репликации ДНК оказался эффективнее традиционного

Процесс удвоения молекул ДНК (репликация) начинается в особых «точках начала репликации» (ТНР) — участках ДНК со специфической последовательностью нуклеотидов, к которым прикрепляются белки, расплетающие двойную спираль и инициирующие репликацию. В геноме солелюбивой археи Haloferax volcanii найдено четыре ТНР. Удаление любой из них, как и следовало ожидать, ведет к замедлению репликации и размножения микробов. Однако одновременное удаление всех четырех ТНР, как ни странно, ускорило репликацию и позволило археям размножаться быстрее. В отсутствие ТНР репликация инициируется «нетрадиционным» способом в произвольных местах хромосомы с обязательным участием ферментов, осуществляющих обмен участками между молекулами ДНК (гомологичную рекомбинацию). Открытие заставляет задуматься о том, зачем вообще нужны ТНР и как они появились. Возможно, изначально они были «эгоистичными генами», заботившимися лишь о собственном размножении, но потом подверглись «молекулярному одомашниванию» и стали приносить пользу, помогая регулировать и упорядочивать репликацию хромосом.
Читать

Comments

Удаление точек начала репликации ускоряет репликацию

[livejournal.livejournal.com]

Пользователь eredraug сослался на вашу запись в записи «Удаление точек начала репликации ускоряет репликацию (http://apokrif93.livejournal.com/17019723.html)» в контексте: [...] Источник сообщения [...]

а может быть это защита от вирусов?

[freedom_of_sea.livejournal.com]

что если более быстрые штаммы, копирующие ДНК без разбора, слишком легко копируют чужую ДНК?

[macroevolution.livejournal.com]

Вполне правдоподобное предположение

[metarattus.livejournal.com]

Именно так я для себя и объясняю наличие единичных-высокоспецифичных ориджинов у прокариот.
В противовес множественным эукариотическим, где ДНК дополнительно изолирована кариолеммой.

[penetrat0r.livejournal.com]

Сорри за возможно дурацкое предположение, но ошибок больше не будет при случайном выборе места копирования?

[macroevolution.livejournal.com]

Не исключено. Но в лабораторных условиях во время тестирования на приспособленность (скорость размножения по сравнению с исходным штаммом) это предполагаемое накопление мутационного груза не проявилось

[penetrat0r.livejournal.com]

Спасибо.
А насколько использованное время тестирования репрезентативно для проявления такого накопления, влияющего на эволюционные перспективы?

[Александр Баженов (from livejournal.com)]

Иногда кажется, будто ДНК сплошь состоит из прилепившихся паразитических генов, которые оказались чем-то полезными для "компании" или нейтральными.

[metarattus.livejournal.com]

Именно поэтому абсолютизация эгоистично-генового подхода мне кажется плохо фальсифицируемой.
Для содержательного теоретизирования нужны по возможности более конкретные формализованные критерии того, что следует называть геном или единицей репликации.

[misha-makferson.livejournal.com]

>Именно поэтому абсолютизация эгоистично-генового подхода мне кажется плохо фальсифицируемой.
Вот-вот. На меня все эти рассуждения об "эгоистичных генах" наводили смутную тоску. Тут даже если от начала начал отталкиватся, то хорошо бы саму концепцию гена как следует продефенировать. А то может все эти гены номинализм чистой воды.

[lkitross.livejournal.com]

А в фейсбуке Вы есть? Скопировал Вашу новость в свой ФБ.

[macroevolution.livejournal.com]

Фейсбук у меня есть, но я им не пользуюсь. Времени не хватает.

[lkitross.livejournal.com]

Я рассматриваю ФБ как сообщение новостей науки и техники, немног и другого. Главное - кратко, так как люди длинного не читают. на могли бы взглянуть одноразово на формат? Здесь.

[levgilman.livejournal.com]

Офтопик, но к месту (в буквальном смысле):
http://sergeyhudiev.livejournal.com/1252292.html

[Александр Баженов (from livejournal.com)]

Видимо, критикам невдомёк, что фраза выдернута из контекста книги (к тому же скорее ради шутки) и не является никаким бездоказательным лозунгом.

[gegmopo4.livejournal.com]

И от этого есть польза. Несколько людей из комментариев узнают о сайте «Элементы.ру (http://elementy.ru/)».

No title

[livejournal.livejournal.com]

Пользователь aunt_dahlia сослался на вашу запись в записи «No title (http://aunt-dahlia.livejournal.com/111453.html)» в контексте: [...] на самом деле!! Клетка совершенно неисчерпаема. http://macroevolution.livejournal.com/144571.html [...]

[combinator30.livejournal.com]

По моему у бактерий нет задачи размножаться как можно быстрее во что бы то ни стало. Гораздо важнее умение регулировать частоту делений таким образом, что бы излишне не надувать без надобности "пузырь" численности организмов если среда не даёт возможности им всем прокормиться. Есть подозрение, что именно эта способность и могла быть в существенной степени утрачена при удалениии всех точек ORI. Кроме того у большинства эубактерий направление чтения генов совершенно явно коррелирует с направлением репликации, причём корреляция особенно сильна в окрестности точки ORI, так что я бы лично не особенно доверял "эгоистичной" гипотезе.
Возможно, ген инициализации репликации (вместе с рядом других ключевых генов, необходимых для размножения) у архей был попросту утрачен в процессе эволюции, а потом соответсвующие механизмы были созданы заново частично на основе механизма репарации хромосомы. Это может, в частности, объяснить и разное воздействие на скорость репликации при удалении точек ORI.