macroevolution

Это большая тема, вкратце не ответишь.
В тексте всё аккуратно: речь про годовалого ребенка, а не про новорожденного.
Человек рождается, конечно, не с готовой моделью мира. Но - с врожденной способностью очень легко и быстро усваивать определенную информацию и приобретать определенные навыки. Например, овладевать речью в определенном возрасте. Врожденной является не речь, а лингвистические способности. А кое-что, самый минимум, новорожденный, по-видимому, уже "знает" сразу - например, отличает лица от не-лиц. Другие животные могут иметь больше такого инстинктивного знания. вовсе не требующего доводки путем обучения.
По пунктам:
1. Мат. носитель - структура связей между нейронами головного мозга.
2. Возникать это может сразу, как только появляется нервная система (т.е. начиная с первых животных с примитивной НС). Механизм формирования - рост нейронов, их отростков, формирование сети синаптических контактов.
3. Обычный, генетический. В принципе структура мозга наследуется так же, как структура скелета.
4. Способна, и механизм эволюции такой же, как у любых других признаков. Мутации и отбор.