А как же тогда можно определить, с какой скоростью должны были идти часы в разных частях дерева (чтобы это было независимо от палеонтологии - а то получится, что результат просто подгоняется под палеонтологические данные, и никакой молекулярной датировки просто нет)?
Несколько точек на дереве привязывают к палеонтологии, а остальные точки и их датировки уже получаются "сами". Вот если калибровать дерево насекомых по палеонтологическим данным о млекопитающих, получится плохо, потому что у насекомых молекулярные часы медленнее идут. А по одним насекомым других насекомых - лучше. В этом вся и фишка.
Совсем независимые от палеонтологии молекулярные датировки получить в принципе можно, и это тоже делается, но там много хитростей. Если точно знать скорость мутирования (а с этим пока проблемы), то скорость накопления нейтральных мутаций в принципе должна быть такой же. И тогда D=2Vt, где D - количество генетических различий между двумя геномами, V - скорость мутирования (в мутациях на 1 геном за 1 поколение), t - время (в поколениях) с момента жизни последнего общего предка. Но для такой датировки годятся только нейтральные мутации. Так можно датировать (и датируют) время жизни последнего общего предка для близких видов или популяций, где можно надеяться, что большинство различий - нейтральные, и что скорость мутирования была постоянная.
![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png)
timeasmymeasure
no subject
Date: 2013-12-25 04:36 pm (UTC)Несколько точек на дереве привязывают к палеонтологии, а остальные точки и их датировки уже получаются "сами". Вот если калибровать дерево насекомых по палеонтологическим данным о млекопитающих, получится плохо, потому что у насекомых молекулярные часы медленнее идут. А по одним насекомым других насекомых - лучше. В этом вся и фишка.
Совсем независимые от палеонтологии молекулярные датировки получить в принципе можно, и это тоже делается, но там много хитростей. Если точно знать скорость мутирования (а с этим пока проблемы), то скорость накопления нейтральных мутаций в принципе должна быть такой же. И тогда D=2Vt, где D - количество генетических различий между двумя геномами, V - скорость мутирования (в мутациях на 1 геном за 1 поколение), t - время (в поколениях) с момента жизни последнего общего предка. Но для такой датировки годятся только нейтральные мутации. Так можно датировать (и датируют) время жизни последнего общего предка для близких видов или популяций, где можно надеяться, что большинство различий - нейтральные, и что скорость мутирования была постоянная.