macroevolution

Попытался прочитать комментарии. Где-то в конце первой или начале второй страницы верно писали, что раз у вас моделирование популяций, то нужно, наверное, параллелить. Дальше, так как задачи относительно простые, то, наверное, надо смотреть или в сторону видеокарт, или в сторону OpenMP. Видеокарты осваивать будет долго и ненужно, поэтому их отбрасываем.
Поэтому остается OpenMP, и в качестве языка или С, или фортран.