macroevolution

Векторизация давно уже подключается практически к любым языкам, поэтому это не аргумент.
Тормоза там в управлении памятью, циклами и прочих чисто программерских вещах, которые норовят вылезти в любых минимально сложных алгоритмах.
Надо понимать, что R никогда не делался как нормальный ЯП. Это язык для стат.расчётов, почти полностью наследованный из древнючего S...
Одно дело обсчитывать таблички, а другое - реализовывать эволюционные (или вообще любые минимально сложные) алгоритмы... R тут совсем не инструмент...