РНК, в т.ч. и т, в геноме кодируются непосредственно по буквам, которых там тоже 4. Т.е. код как таковой им и не нужен. Ибо код используется только для трансляции - выбора аминокислот по кодонам.
По второму вопросу - ну так области, отвечающие за запуск транскрипции (т.е. РНК с ДНК) и области, отвечаюищие за запуск трансляции (синтез белка) - это совершенно не одно и то же.

Т.о. для РНК, которая не предназначена быть матрицей, достаточно просто не иметь в своей последовательности характерных областей, приводящих к посадке рибосом и к инициации трансляции. Просто так без специальных для того предназначенных последовательностей рибосомы любую мимо проплывающую РНК не схватят и не белок с неё читать не примутся :)