macroevolution (![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png)
macroevolution) wrote2014-04-20 05:05 pm
macroevolution) wrote2014-04-20 05:05 pm
Вопрос к коллегам.
Вот новая статья в Journal of Human Evolution
How old are chimpanzee communities? Time to the most recent common ancestor of the Y-chromosome in highly patrilocal societies
Речь идет об оценке времени существования сообществ шимпанзе. Сообщества строго патрилокальны: мальчики остаются в родном сообществе, девочки разбегаются; новые сообщества образуются редко и не совсем понятно как, но предполагается, что число самцов-основателей невелико.
Авторы взяли в 8 сообществах шимпанзе из Восточной Африки пробы ДНК самцов (всего 182 самца, в среднем по 23 на сообщество) и рассчитали для каждого сообщества, на основе вариабельности Y-хромосомы, время жизни последнего общего предка (TMRCA) по мужской линии. Рассчитали и молодцы. Но почему-то они утверждают, что момент возникновения сообщества не может быть древнее, чем TMRCA.
Например, они пишут:
"In both the multi-male and one-male fissioning scenarios, new chimpanzee communities are formed by a relatively small number of paternally related male founders. This has important implications for our understanding of the relationship between (1) the TMRCA of a set of extant chimpanzee Y-chromosome haplotypes in a community, and (2) the timing of when the community was originally founded. Although the former always occurs before (i.e., further back in time than) the latter..."
Или:
"Because of the fact that Y-STR TMRCA always predates the timing of the founding of the community, Y-STR TMRCAs are not informative as to the minimum age of a chimpanzee community, but rather only the maximum possible age of a community"
Не понимаю, почему "Y-хромосомный Адам" данного сообщества не мог жить много позже момента формирования сообщества? Тем более - почему это подается даже не как вероятность, а как "факт". Ведь Y-хромосомные линии теряются из-за дрейфа. Тем более, сообщества-то небольшие: обычно <<100 самцов в сообществе. Мне кажется, в данном случае TMRCA может быть как сильно древнее, так и сильно моложе момента формирования сообщества. Где ошибка?
How old are chimpanzee communities? Time to the most recent common ancestor of the Y-chromosome in highly patrilocal societies
Речь идет об оценке времени существования сообществ шимпанзе. Сообщества строго патрилокальны: мальчики остаются в родном сообществе, девочки разбегаются; новые сообщества образуются редко и не совсем понятно как, но предполагается, что число самцов-основателей невелико.
Авторы взяли в 8 сообществах шимпанзе из Восточной Африки пробы ДНК самцов (всего 182 самца, в среднем по 23 на сообщество) и рассчитали для каждого сообщества, на основе вариабельности Y-хромосомы, время жизни последнего общего предка (TMRCA) по мужской линии. Рассчитали и молодцы. Но почему-то они утверждают, что момент возникновения сообщества не может быть древнее, чем TMRCA.
Например, они пишут:
"In both the multi-male and one-male fissioning scenarios, new chimpanzee communities are formed by a relatively small number of paternally related male founders. This has important implications for our understanding of the relationship between (1) the TMRCA of a set of extant chimpanzee Y-chromosome haplotypes in a community, and (2) the timing of when the community was originally founded. Although the former always occurs before (i.e., further back in time than) the latter..."
Или:
"Because of the fact that Y-STR TMRCA always predates the timing of the founding of the community, Y-STR TMRCAs are not informative as to the minimum age of a chimpanzee community, but rather only the maximum possible age of a community"
Не понимаю, почему "Y-хромосомный Адам" данного сообщества не мог жить много позже момента формирования сообщества? Тем более - почему это подается даже не как вероятность, а как "факт". Ведь Y-хромосомные линии теряются из-за дрейфа. Тем более, сообщества-то небольшие: обычно <<100 самцов в сообществе. Мне кажется, в данном случае TMRCA может быть как сильно древнее, так и сильно моложе момента формирования сообщества. Где ошибка?
no subject
the work of Motoo Kimura[6] developed the neutral theory of molecular evolution, which predicted a molecular clock. Let there be N individuals, and to keep this calculation simple, let the individuals be haploid (i.e. have one copy of each gene). Let the rate of neutral mutations (i.e. mutations with no effect on fitness) in a new individual be M. The probability that this new mutation will become fixed in the population is then 1/N, since each copy of the gene is as good as any other. Every generation, each individual can have new mutations, so there are MN new neutral mutations in the population as a whole. That means that each generation, M neutral mutations will become fixed. If most changes seen during molecular evolution are neutral, then fixations in a population will accumulate at a clock-rate that is equal to the rate of neutral mutations in an individual.