macroevolution: (anomalocaris)
macroevolution ([personal profile] macroevolution) wrote2013-11-13 10:46 pm

Удаление точек начала репликации ускоряет репликацию

Замечательное исследование, некоторым образом проливающее свет на происхождение механизмов репликации ДНК
Спасибо [livejournal.com profile] progenes за наводку и всем коллегам, приславшим pdf! )

Альтернативный способ репликации ДНК оказался эффективнее традиционного

Процесс удвоения молекул ДНК (репликация) начинается в особых «точках начала репликации» (ТНР) — участках ДНК со специфической последовательностью нуклеотидов, к которым прикрепляются белки, расплетающие двойную спираль и инициирующие репликацию. В геноме солелюбивой археи Haloferax volcanii найдено четыре ТНР. Удаление любой из них, как и следовало ожидать, ведет к замедлению репликации и размножения микробов. Однако одновременное удаление всех четырех ТНР, как ни странно, ускорило репликацию и позволило археям размножаться быстрее. В отсутствие ТНР репликация инициируется «нетрадиционным» способом в произвольных местах хромосомы с обязательным участием ферментов, осуществляющих обмен участками между молекулами ДНК (гомологичную рекомбинацию). Открытие заставляет задуматься о том, зачем вообще нужны ТНР и как они появились. Возможно, изначально они были «эгоистичными генами», заботившимися лишь о собственном размножении, но потом подверглись «молекулярному одомашниванию» и стали приносить пользу, помогая регулировать и упорядочивать репликацию хромосом.
Читать

Удаление точек начала репликации ускоряет репликацию

[identity profile] livejournal.livejournal.com 2013-11-12 06:46 pm (UTC)(link)
Пользователь [livejournal.com profile] eredraug сослался на вашу запись в записи «Удаление точек начала репликации ускоряет репликацию (http://apokrif93.livejournal.com/17019723.html)» в контексте: [...] Источник сообщения [...]

а может быть это защита от вирусов?

[identity profile] freedom_of_sea.livejournal.com 2013-11-12 06:48 pm (UTC)(link)
что если более быстрые штаммы, копирующие ДНК без разбора, слишком легко копируют чужую ДНК?

[identity profile] penetrat0r.livejournal.com 2013-11-12 06:52 pm (UTC)(link)
Сорри за возможно дурацкое предположение, но ошибок больше не будет при случайном выборе места копирования?

[identity profile] Александр Баженов (from livejournal.com) 2013-11-12 07:11 pm (UTC)(link)
Иногда кажется, будто ДНК сплошь состоит из прилепившихся паразитических генов, которые оказались чем-то полезными для "компании" или нейтральными.

[identity profile] lkitross.livejournal.com 2013-11-12 07:20 pm (UTC)(link)
А в фейсбуке Вы есть? Скопировал Вашу новость в свой ФБ.

[identity profile] levgilman.livejournal.com 2013-11-13 06:53 am (UTC)(link)
Офтопик, но к месту (в буквальном смысле):
http://sergeyhudiev.livejournal.com/1252292.html

No title

[identity profile] livejournal.livejournal.com 2013-11-13 07:12 am (UTC)(link)
Пользователь [livejournal.com profile] aunt_dahlia сослался на вашу запись в записи «No title (http://aunt-dahlia.livejournal.com/111453.html)» в контексте: [...] на самом деле!! Клетка совершенно неисчерпаема. http://macroevolution.livejournal.com/144571.html [...]

[identity profile] combinator30.livejournal.com 2013-11-13 10:04 am (UTC)(link)
По моему у бактерий нет задачи размножаться как можно быстрее во что бы то ни стало. Гораздо важнее умение регулировать частоту делений таким образом, что бы излишне не надувать без надобности "пузырь" численности организмов если среда не даёт возможности им всем прокормиться. Есть подозрение, что именно эта способность и могла быть в существенной степени утрачена при удалениии всех точек ORI. Кроме того у большинства эубактерий направление чтения генов совершенно явно коррелирует с направлением репликации, причём корреляция особенно сильна в окрестности точки ORI, так что я бы лично не особенно доверял "эгоистичной" гипотезе.
Возможно, ген инициализации репликации (вместе с рядом других ключевых генов, необходимых для размножения) у архей был попросту утрачен в процессе эволюции, а потом соответсвующие механизмы были созданы заново частично на основе механизма репарации хромосомы. Это может, в частности, объяснить и разное воздействие на скорость репликации при удалении точек ORI.