macroevolution: (anomalocaris)
macroevolution ([personal profile] macroevolution) wrote2013-02-22 04:35 pm

Про митохондриальную Еву, Чингисхана и общих предков: считаем на коленке

Если вы, уважаемый читатель, родом из России, то почти наверняка вы прямой потомок Рюрика, Ярослава Мудрого и Чингисхана впридачу. Если для вас это - известный, тривиальный факт, то можете дальше не читать. Но многим это совсем не очевидно.

Недавно в каком-то английском научном блоге мне попалось стандартное ошибочное утверждение, что якобы "митохондриальная Ева - последний общий предок всего современного человечества".
Интересно, все ли читатели отчетливо понимают, что вообще-то мт-Ева популяции, как правило, должна быть намного старше (т.е. древнее) последнего общего предка всех современных особей в популяции?
Мт-Евы, как и Y-хромосомные Адамы, образуются за счет генетического дрейфа. Если в поколении 0 было N самок, то рано или поздно за счет дрейфа в популяции останутся потомки по прямой женской линии только одной из них. Процесс чисто случайный, но конечный результат его неизбежен. Вот пример работы программы, которая этот процесс имитирует:
eve
Модель такая: популяция с постоянной численностью, в каждом поколении - 25 самок (самцы в данном случае игнорируются). Каждая самка оставляет от 0 до 4 дочерей (случайно); затем из общего числа дочерей случайно отбирается 25, которые и составляют следующее поколение. Мы следим за генеалогией потомков каждой из исходных 25 самок. В данном случае через 24 поколения в популяции остались только потомки по прямой женской линии самки 1. Она и является мт-Евой для поколения 24.
Ожидаемое число поколений, которое должно пройти до того, как какая-то одна самка из поколения 0 станет мт-Евой, примерно того же порядка, что и численность популяции.
мт-Ева - общая праматерь всей популяции по прямой женской линии. Не "вообще", а по прямой женской линии. Это важно.
Более подробное, превосходное объяснение про Ев см. в статье Базыкина: http://elementy.ru/lib/431702

Что касается последнего общего предка "вообще", то есть по любой линии, а не только по прямой женской, то он формируется принципиально быстрее.
Допустим, есть популяция с постоянной численностью, панмиктическая (не подразделенная на репродуктивно изолированные группы). В такой популяции среднестатистическая особь (это справделиво в равной степени и для самок, и для самцов) оставляет ровно двух потомков, которые примут участие в размножении. Внуков у такой среднестатистической особи будет 4, правнуков 8 и т.д. До тех пор, пока особи избегают родственных скрещиваний, число потомков каждой особи будет расти как 2k, где k - число прошедших поколений.
Поэтому уже через log2N поколений кто-то из поколения 0 может стать общим предком всех ныне живущих особей в популяции. А еще столько же поколений пройдет - и почти наверняка каждая особь поколения 0 окажется либо общим предком всех ныне живущих, либо у нее вообще не будет живых потомков.
Грубо говоря, мы можем рассчитывать найти последнего общего предка всех ныне живущих особей примерно  log2N поколений назад (для популяции с численностью N=1000 это будет примерно 10 поколений назад, для 100000 – 17 поколений, 10 млн – 23 поколения). Совсем недавно!

А вот мт-Ева такой популяции будет сидеть гораздо дальше в прошлом: например, 1000, 100000, 10 млн поколений назад. Бутылочные горлышки численности, конечно, сильно омолаживают Ев. Но всё-таки Ева должна быть радикально старше последнего общего предка. Потому что число "просто потомков" будущего ОП закономерно растет как снежный ком (как 2k), а число носителей мтДНК будущей Евы увеличивается только за счет случайного дрейфа. В популяции, где каждая пара рождала бы строго двоих детей - мальчика и девочку - число носителей мтДНК самки из поколения 0 оставалось бы из поколение в поколение равным 1.

Еще одна интересная задачка, связанная с вышесказанным.
В 2003 году генетики обнаружили, что примерно 16 миллионов современных азиатов несут Y-хромосому Чингисхана, т.е. являются его потомками по прямой мужской линии (полный текст статьи). Вот как выгодно (с эволюционно-генетической т.зр.) быть великим завоевателем!
khan

Вопрос: сколько же современных потомков у Чингисхана всего (не только по прямой мужской, а по любой линии)?
Если бы Чингисхан был не великим завоевателем, а простым среднестатистическим человеком, и если бы чингизиды старательно избегали скрещиваний с другими чингизидами (смелое допущение, но оно мало влияет на конечный результат, потому что результат получается с огромным "запасом"), то можно было бы ожидать, что сегодня, когда со времени жизни Чингисхана минуло 32 поколения, число его потомков было бы равно 232=4,3 миллиарда. И это без помощи отбора, без учета завоеваний!
Дальше. В модели, где каждая пара оставляет ровно двух потомков - мальчика и девочку - сколько людей из этих 4 миллиардов были бы носителями Y-хромосомы Чингисхана? Если у него 4 млрд потомков, сколько из них несет его Y-хромосому? Я спросил у двух крупных биологов и оба, недолго думая, сказали: наверное, 2 млрд! Ошибочка. Правильный ответ - 1 (один) человек. Проверяйте, проверяйте.

Значит, отбор (т.е. то преимущество в размножении, которое получили чингизиды благодаря своим военным успехам) увеличил число потомков Ч. по прямой мужской линии в 16 млн раз против ожидаемого. Если бы такой же силы отбор помогал всем чингизидам, а не только чингизидам по прямой мужской линии, то можно было бы ожидать, что у него будет сегодня 4,3 млрд * 16 млн потомков - число, на много порядков превышающее население планеты.
Разумеется, у Ч. в действительности куда меньше потомков, потому что в действительности чингизиды - из-за ограниченности населения земли - никак не могли всегда избегать браков с другими чингизидами. Но мы можем не сомневаться, что ВСЁ население Азии, поголовно, кроме разве что каких-нибудь реликтовых изолированных горных племен, 800 лет женившихся только на "своих" - всё население Азии - потомки Чингисхана. Я вам это гарантирую. Этот вывод делается с большим "запасом", означающим, что многие азиаты - чингизиды не по одной, а по многим линиям сразу.
По той же логике все или почти все современные русские - наверняка потомки Рюрика (рюриковичей в 12 веке были тысячи, князь сидел в каждом селе, так что можете не сомневаться). А поскольку какое-никакое скрещивание чингизидов со славянами, конечно, было, то все русские почти наверняка и чингизиды тоже, а не только рюриковичи. У кого хоть малейшая еврейская примесь есть, тот может без сомнений и царя Соломона в список своих прямых предков добавить.
Все люди братья, одним словом.
Вещи очевидные, но малоизвестные, контринтуитивные и с трудом до сознания доходящие.

[identity profile] the-third-way.livejournal.com 2013-02-22 12:54 pm (UTC)(link)
Ага, знакомая песенка - "поскреби русского, найдешь татарина". И сколько не публикуй данных, что примесь азиатских аллелей у русских практически нулевая, все равно пластинка не останавливается.

[identity profile] lex-divina.livejournal.com 2013-02-22 01:06 pm (UTC)(link)
Так ведь из вышеприведенной арифметики никоим образом не следует, что большая часть современных потомков Чингисхана должны делить с ним половину, четверть или хотя бы одну сотую часть общих генов.

[identity profile] the-third-way.livejournal.com 2013-02-22 01:52 pm (UTC)(link)
Да понятно. Да и арифметика эта к реальности отношение слабое имеет.

[identity profile] set-o-lopata.livejournal.com 2013-02-22 04:00 pm (UTC)(link)
Да? Арифметика не имеет отношения к реальности? Ну-ну.

[identity profile] the-third-way.livejournal.com 2013-02-22 04:01 pm (UTC)(link)
ЭТА арифметика. С чтением проблемы? Или вы в самом деле думаете, что такие примитивные "модели" отражают реальность?

[identity profile] farwideserenity.livejournal.com 2013-02-22 02:58 pm (UTC)(link)
обезьянка, русский генофонд имеет три главных источника: финны, европейцы (в первую очередь, восточные славяне) и татары (но не монголы).

"Так, по Y-хромосоме генетическое расстояние между русскими и финнами составляет 30 условных единиц. А генетическое расстояние между русским человеком и так называемыми финноугорскими народностями (марийцами, вепсами и пр.), проживающими на территории РФ, равно 2-3 единицам. Проще говоря, генетически они почти идентичны... русские от татар находятся на том же генетическом расстоянии в 30 условных единиц, которые отделяют нас от финнов
Подробнее: http://www.kommersant.ru/doc/611986."

"Почему, несмотря на длительное монголо-татарское иго, на русском генофонде не сказался этот след?
- Как ни странно, он не особо сказался и на татарах... Как славяне ассимилировали западные финно-угорские племена, так же предки татар, чувашей и башкир ассимилировали восточных финно-угров... Так что различия между русским и татарским генофондом хотя и есть, они вовсе не колоссальные - русский полностью европейский, а татарский - по большей части европейский.
http://newsland.com/news/detail/id/235786/

Монголоидных русских людей в районах, граничащих с монголоидным населением, очень много.

[identity profile] the-third-way.livejournal.com 2013-02-22 03:02 pm (UTC)(link)
Автору блога: на вашем месте, я забанил бы этого хама.

[identity profile] bioplant.livejournal.com 2013-02-22 03:47 pm (UTC)(link)
т.е. по вашим данным, подтверждается версия, что татаро-монгольское иго - это миф?

[identity profile] vodka-seledtka.livejournal.com 2013-02-22 08:07 pm (UTC)(link)
Нашествие и разрушение-совсем не миф.
А смешение носило ну уж совсем еденичный характер.
Либо насилие и вспарывние живота-потомков нет,либо,когда субект вожделения невозможно желанен-отправка в метрополию.
Потому в современной Монголии детектед R1A чаще чем монголоидность(не путать с лапоноидностью)в европейской части РФ
Edited 2013-02-22 20:08 (UTC)

[identity profile] am-tiger-a.livejournal.com 2013-02-22 11:08 pm (UTC)(link)
В современной Монголии (как и вообще в Центральной Азии) есть R1a-S202, которые попали туда с т.н. ариями (носителями прото-индоиранских языков).

В Европе типичны другие кластеры R1a: R1a-L664, R1a-S339 (из этих субкластеры R1a-M458 и R1a-S204 типичны для славян, а R1a-S221 типичен для скандинавов).

[identity profile] vodka-seledtka.livejournal.com 2013-02-23 08:56 pm (UTC)(link)
Не являсь крупным специалистом по теме,тихо себе считал Z 284 славянобалтийским субкладом.
Спорить не буду.Просветите-буду рад.
Edited 2013-02-23 20:56 (UTC)

[identity profile] am-tiger-a.livejournal.com 2013-02-24 01:21 am (UTC)(link)
Нет, R1a-S221 (= R1a-Z284) это типично скандинавский кластер. Видимо Вы перепутали его с R1a-S204 (= R1a-Z280).

[identity profile] farwideserenity.livejournal.com 2013-02-23 05:58 am (UTC)(link)
дело в том, что в "татаро-монголах" монголов было всего несколько процентов. Это давно и точно установлено историками. Про вспарывание живота и прочее - дегенератский фашистский бред.

[identity profile] el-queue.livejournal.com 2013-02-22 05:05 pm (UTC)(link)
современные татары - это фино-угоры и к монголо-татарам прямого отношения не имеют.

[identity profile] the-third-way.livejournal.com 2013-02-22 05:11 pm (UTC)(link)
А вот инвектива подразумевает как раз тех самых татар.

[identity profile] vodka-seledtka.livejournal.com 2013-02-22 07:00 pm (UTC)(link)
А до того были антропологические методы. Монголоидности не нашли.
С историей всё соотносится-насилие было-выживших не было.
Пришло время недорогих митохондриальных анализов.нашли включеня R1A1 в Монголии(не наоборот),но пофиг.
Есть немалый процент лапоноидной субрасы(даже в Баварии-10%)
Но кому это интересно?

[identity profile] the-third-way.livejournal.com 2013-02-22 07:02 pm (UTC)(link)
Не дадим фактам стать на пути интересной истории! Как-то так.

[identity profile] vodka-seledtka.livejournal.com 2013-02-22 07:55 pm (UTC)(link)
За историю(с анропологией за одно) как то обидно...

[identity profile] unton990.livejournal.com 2013-02-23 09:04 am (UTC)(link)
<Пришло время недорогих митохондриальных анализов.нашли включеня R1A1 в Монголии(не наоборот),но пофиг.>
Из этого выходит,что заключались браки мужчин славян с монгольскими женщинами? Или я не прав? Буду признателен если проясните.

[identity profile] vodka-seledtka.livejournal.com 2013-02-23 08:33 pm (UTC)(link)
Не, не следует такой вывод делать.
Такой анализ(а он наиболее дешев) расказывает больше о предках по материнской линии.Но "меньше" тоже существует.
Если действительно интересно-напишите в личку,поделюсь ссылками,и после прочтения откоментирую неясные моменты
iws: (Таватуй-2008)

[personal profile] iws 2013-02-22 08:27 pm (UTC)(link)
Ну так только вас оскобляет 0.0000000001 доля русского.

[identity profile] the-third-way.livejournal.com 2013-02-22 08:37 pm (UTC)(link)
Что за дичь вы несете?
iws: (Коршун)

[personal profile] iws 2013-02-22 10:35 pm (UTC)(link)
Дичь несете вы. Да еще и гордитесь этим. Такова уж ваша русофобская доля.

[identity profile] the-third-way.livejournal.com 2013-02-23 12:14 am (UTC)(link)
Вы не внимательно читаете. Или сарказма не поняли)
iws: (Ведмед)

[personal profile] iws 2013-02-23 12:32 am (UTC)(link)
Возможно. У меня по ночам с сарказмом не очень. Прошу прощения, если так.