Вот здесь - http://www.computerra.ru/own/shabanov/653504/ этот вопрос уже обсуждали. И Преподобный Михаил Ваннах вот что об этом написал:

"Душа у Маркова используется, ЕМНИП (оба экземпляра уже раздарил - на Рождество) вполне корректно с точки зрения протестантского мейнстрима.
Душа - нЕфеш (евр.), психэ (др-гр.), анима (лат.). Это - природные чувства и побуждения у физической жизни во всех ее формах, даже у водных животных (Бытие 1;20). Душа нуждается в пище и питье (Лука, 12:19), смертна.
Дух - рУах, пневма,спиритус - именно он может быть бессмертен. Хотя функции духа и души в Писании (не говоря об обычной речи) пересекаются. Правда, скорее метафорически.

Да, конечно. Чаще всего говорят о бессмертии именно души, а не духа. Но разделены они с духом достаточно четко! (Даже не знаю, какую аналогию такой метафоричности понятий из естествознания привести...)

Скажем из ИТ подошла бы аналогия процесса. Процесс, замеряемый осциллоскопом, мог бы быть соотнесен с душой-анимой.
Информационное содержание процесса (тут оппозиция программе) - духу-спириту.
И процесс еще используется в философии процесса Уатхеда. Где-то так..."

Но стоит заметить, что это "протестантский мэйнстрим", другая контора :о)