macroevolution: (Default)
macroevolution ([personal profile] macroevolution) wrote2017-01-16 12:52 pm

Вот мы тут сидим, а люди открывают новые надтипы

Описан новый надтип архей, к которому относятся предки эукариот

Современные методы метагеномного анализа уже позволяют собирать из фрагментов ДНК, выделенных из проб воды, донных осадков, почвы и других сред, целые геномы микроорганизмов, в том числе новых для науки. В 2015 году таким способом были открыты локиархеи — неизвестная ранее группа архей, близкая к эукариотам. Целенаправленный поиск микробов, родственных локиархеям, привел к обнаружению большой и разнообразной группы, заслуживающей ранга надтипа и получившей название «Асгард». В эту группу, помимо описанных ранее локиархей и торархей, входят два новых типа: одинархеи и хеймдалльархеи. В геномах асгардархей закодировано множество белков, ранее считавшихся характерными только для эукариот, в том числе многие компоненты цитоскелета, а также молекулярные системы, отвечающие за везикулярный транспорт и убиквитин-зависимую деградацию белков. Никто пока не видел асгардархей под микроскопом, но геномные данные указывают на более сложную организацию их клеток по сравнению с обычными прокариотами. Предки эукариот почти наверняка были асгардархеями, возможно, близкими к хеймдалльархеям. Открытие показало, что ряд шагов в сторону усложнения организации был сделан предками эукариот задолго до приобретения митохондриального симбионта.

Читать полностью

Схема клеточных процессов, в которых у эукариот участвуют белки, ранее считавшиеся уникальными для эукариот, но теперь обнаруженные у архей из новооткрытого надтипа.
gegmopo4: (Default)

[personal profile] gegmopo4 2017-01-16 03:26 pm (UTC)(link)
Вроде бы до апреля ещё два с половиною месяца.

[identity profile] prokhozhyj.livejournal.com 2017-01-16 10:07 am (UTC)(link)
Вышли мы все из Асгарда...

[identity profile] macroevolution.livejournal.com 2017-01-16 10:33 am (UTC)(link)
Великие с малыми
Хеймдалля дети

Вышли мы все из Асгарда...

[identity profile] livejournal.livejournal.com 2017-01-16 10:42 am (UTC)(link)
Пользователь [livejournal.com profile] prokhozhyj сослался на вашу запись в своей записи «Вышли мы все из Асгарда... (http://prokhozhyj.livejournal.com/2023420.html)» в контексте: [...] this archaeal clade Asgard..." Zaremba-Niedzwiedzka et al., 2017        Via [...]

[identity profile] toothedgoo.livejournal.com 2017-01-16 11:29 am (UTC)(link)
У меня есть подозрение, что большинство открытий совершается в том же положении, в сидячем.

[identity profile] gilgamesh-lugal.livejournal.com 2017-01-16 11:38 am (UTC)(link)
И сюда проникла чума норманизма! Необходимо со всей решительностью заявить, что ни из какого "асгарда" мы не происходили. Славяне мы, емелярхеи и кузьмархеи!

Вышли мы все из Асгарда...

[identity profile] livejournal.livejournal.com 2017-01-16 12:13 pm (UTC)(link)
Пользователь [livejournal.com profile] _hellmaus_ сослался на вашу запись в своей записи «Вышли мы все из Асгарда... (http://users.livejournal.com/-hellmaus-/168295.html)» в контексте: [...] this archaeal clade Asgard..." Zaremba-Niedzwiedzka et al., 2017       Via [...]

Турецкая эволюция

[identity profile] livejournal.livejournal.com 2017-01-16 12:19 pm (UTC)(link)
Пользователь [livejournal.com profile] olegkorsun сослался на вашу запись в своей записи «Турецкая эволюция (http://olegkorsun.livejournal.com/384826.html)» в контексте: [...] ещё долго. Интересные открытия делаются едва ли не ежедневно. Вот, например, из сегодняшнего ЖЖ [...]

[identity profile] chyyr.livejournal.com 2017-01-16 03:36 pm (UTC)(link)
Что за греческая тарабарщина?

Мы ярилостаричи и даждьбожестаричи!

[identity profile] the-toad.livejournal.com 2017-01-16 04:42 pm (UTC)(link)
...он вышел и упал на снег

[identity profile] trim-c.livejournal.com 2017-01-16 06:09 pm (UTC)(link)
Простите мне мое невежество.
Но верно ли я понял, что вот открыт надтип, а внем открыты 4 типа.

Но при этом нет ни одного вида и никто не видел ни единого представителя?
Edited 2017-01-16 18:13 (UTC)

[identity profile] trim-c.livejournal.com 2017-01-16 06:14 pm (UTC)(link)
Простите мне мое невежество.
Но верно ли я понял, что вот открыт надтип, а внем открыты 4 типа.

Но при этом нет ни одного вида и никто не видел ни единого представителя?

[identity profile] Екатерина Щулепникова (from livejournal.com) 2017-01-16 06:16 pm (UTC)(link)
Не-а, это все Паньгу постарался.

[identity profile] apollo-musaget.livejournal.com 2017-01-16 06:16 pm (UTC)(link)
Кошка-дрозофила.

[identity profile] Екатерина Щулепникова (from livejournal.com) 2017-01-16 06:17 pm (UTC)(link)
Пошли все срочно Ирий искать.

[identity profile] myugor.livejournal.com 2017-01-16 06:59 pm (UTC)(link)
С добавлением кавычек и гордого слова Candidate. Candidate Superphylum "Asgard" и четыре Candidate Phyla. Вот дьявол, ошибся сначала.
Edited 2017-01-16 19:02 (UTC)

[identity profile] trim-c.livejournal.com 2017-01-16 07:06 pm (UTC)(link)
Спасибо!
Но я вот как прикладной математик смотрю на эту красоту - и меня мучит мысль, не слишком ли далеко забрались теоретики?

[identity profile] myugor.livejournal.com 2017-01-16 07:30 pm (UTC)(link)
Другая компания биоинформатиков примерно так же недавно удвоила разнообразие бактерий. А что делать? Кучу всякой прокариотической живности просто не удается культивировать. Так им и ходить в кандидатах, пока кто-то не подберет условия и среды.
Увидеть их теперь, может быть, и удастся, есть методы, но много информации из этого не вытянешь. Скорее, займутся собиранием полных геномов. Пока, насколько я понял, там малые кусочки.
Edited 2017-01-16 19:39 (UTC)

[identity profile] trim-c.livejournal.com 2017-01-16 07:59 pm (UTC)(link)
Т.е. когда это все станет уст ановленным фактом - бог весть?

[identity profile] chyyr.livejournal.com 2017-01-16 08:22 pm (UTC)(link)
На дне моря-окияна подле остова Буяна стоит бел-горюч Алатырь-камень. На нем и проходили ранние этапы эволюции эукариот ступени развертывания благоядерных.

[identity profile] chyyr.livejournal.com 2017-01-16 08:27 pm (UTC)(link)
Кошка-дроздофила.
Была у меня такая.

[identity profile] prokhozhyj.livejournal.com 2017-01-16 08:58 pm (UTC)(link)
> На дне моря-окияна подле остова Буяна стоит бел-горюч Алатырь-камень.

"Белый курильщик", явно. Опять гидротермы!

[identity profile] prokhozhyj.livejournal.com 2017-01-16 09:01 pm (UTC)(link)
Что именно? Наличие в природе существ с вот такими геномами – установленный факт. Как волчий след делает установленным фактом наличие волка в лесу, даже если его самого и не видели.

[identity profile] myugor.livejournal.com 2017-01-17 05:23 am (UTC)(link)
Геном геномом, но как они выглядят? Что у них внутри? Как они живут? Кроме самых общих свойств, "водородный сульфатредуктор и ацетоген", даже о локиархеуме gc14-75 ничего не известно, а об остальных локиархеях и того меньше. А есть ли у них внутриклеточные мембраны? Есть ли и как выглядит их эндоцитоз? Этого геномы все-таки не скажут.
Такая же история с новыми группами простейших. Они есть, они родственники известных групп, и ничего больше.
Edited 2017-01-17 05:25 (UTC)

[identity profile] trim-c.livejournal.com 2017-01-17 08:24 am (UTC)(link)
Хотя и не исключено, что след этот - собачий. Одного следа мало.
На мой непрофессиональный взгляд.

В данной ситуации цепи реконструкций очень длинные, упоры на математику очень сильные. Конструкции начинают подвисать, когда конструкциии большие а опытная база - маловата. Я не говорю, что так произошло сейчас. Я говорю об общем ощущении. Пирамиды опертой на вершину.

Page 1 of 2