macroevolution: (anomalocaris)
macroevolution ([personal profile] macroevolution) wrote2013-11-21 04:08 pm

Наш мозг под контролем вирусов

Нет, это не то, что вы подумали (на этот раз)
Самый настоящий ретровирус, встроившийся в геном, в 22-ой хромосоме Homo sapiens.

Российские ученые показали, что один из 133 эндогенных ретровирусов, встроившихся в наш геном после разделения эволюционных линий человека и шимпанзе, подвергся «молекулярному одомашниванию» и теперь функционирует в качестве регуляторного элемента, управляющего работой гена PRODH в некоторых отделах мозга (в первую очередь в гиппокампе). Ген PRODH участвует в синтезе нейромедиаторов, а его важность для работы мозга подтверждается тем, что мутации в нем влияют на риск развития шизофрении. Ретровирус содержит в себе два участка, к которым прикрепляется регуляторный белок SOX2, что приводит к увеличению активности PRODH в мозге. Вся совокупность полученных данных говорит о том, что данная ретровирусная вставка сыграла какую-то роль в эволюции человеческого мозга.

Читать полностью

Тут что интересно (кроме самого открытия, разумеется).
Во-первых, любо-дорого читать список мест работы авторов. Удивительно, что в нашей суровой реальности еще существуют подобные коллективы, ухитряющиеся делать науку на таком уровне. Браво! И спасибо Антону Буздину (он, кстати, пару лет назад делал доклад на нашем семинаре) за оперативное информирование о выходе статьи и pdf.

Ну а еще - к недавним дебатам. К вопросу о смене функций регуляторных генов. Можно подумать, белку SOX2 вообще нечего больше делать было, кроме как взять на себя еще и регуляцию пролин-дегидрогеназы в гиппокампе.

[identity profile] askondrashov.livejournal.com 2013-11-21 09:08 pm (UTC)(link)
Имею по этому случаю поучительную историю. Что млекопитающие могут одомашнивать транспозоны, так это открыли мы - в смысле моя лаборатория в NCBI - путем тупого сравнения геномов человека и мыши - там сидят ортологичные транспозоны, от которых, если бы не отрицательный отбор, не осталось бы никаких следов. Работу эту делала мой постдок Джоана Силва - и начала она в 2000г. кажется - полного генома человека еще точно не было. И мы три года не могли это опубликовать - поскольку "всем известно", что транспозоны - это junk. Нас отвергли Genetics, MBE и еще 2 или 3 журнала. В конце концов Trudy Mackay, будучи главным редактором, опубликовала это в Genetical Research - наплевав на две отрицательные рецензии козлов-транспозоноведов, поскольку и тогда идиоту было ясно, что мы правы. В результате мы потеряли чистый приоритет - пока нас мордовали по журналам, Кунинские орлы открыли то же явление на совершенно другом материале - а Джоана чуть не ушла из науки. А теперь рекрутирование транспозонов и прочей дряни - общее место, и на нас тоже не ссылаются, поскольку "это и так все давно знают".

Третий автор в статье - Джоанин мужик. Он тогда служил в Агенстве национальной безопасности (где Сноуден) и помогал программировать. Так ему получить разрешение на публикацию у самых ужасных американских гбистов оказалось куда проще, чем преодолеть сопротивление ученых. Причем я не думаю, что там был злой умысел. Просто козлизм.

Мораль - жизнь несправедлива, но надо рыпаться.

Conserved fragments of transposable elements in intergenic regions: evidence for widespread recruitment of MIR- and L2-derived sequences within the mouse and human genomes
Author(s): Silva, JC (Silva, JC); Shabalina, SA (Shabalina, SA); Harris, DG (Harris, DG); Spouge, JL (Spouge, JL); Kondrashov, AS (Kondrashov, AS)
Source: GENETICS RESEARCH Volume: 82 Issue: 1 Pages: 1-18 DOI: 10.1017/S0016672303006268 Published: AUG 2003
Times Cited: 38 (from Web of Science)

[identity profile] bbzhukov.livejournal.com 2013-11-21 09:13 pm (UTC)(link)
Прелесть какая! А можно эту историю цитировать?

[identity profile] askondrashov.livejournal.com 2013-11-21 09:21 pm (UTC)(link)
Так можно! Я никаких подписок о неразглашении не давал. В какой-то момент я позвонил редактору Genetics (уж не буду называть имени), который вел нашу статью, и с которым мы были по корешам, и сказал - "Что же ты, падла, делаешь - ты ведь понимаешь, что мы правы?". На что это крупный генетик ответил - "Ну да, конечно, но рецензентами были самые авторитетные специалисты по транспозонам". Уписался, короче. А Труди отвязанная - никого не боится, этого у нее не отнимешь.

[identity profile] bbzhukov.livejournal.com 2013-11-21 09:49 pm (UTC)(link)
Спасибо! И за это дополнение - еще отдельно.

"Ну да, конечно, но рецензентами были самые авторитетные специалисты по транспозонам"
"- Леонид Ильич, это Маргарет Тэтчер!
- Да сам вижу, что Тэтчер, но здесь-то написано "Ганди"!"
((с) анекдот времен нашей молодости)

[identity profile] yarjournal.livejournal.com 2013-11-22 08:11 am (UTC)(link)
Спасибо, очень любопытно!