Ну.. я предпочитаю понимать самоорганизацию как широкое, в некотором смысле философское понятие - любое сколько-либо нетривиальное последствие взаимодействия большого числа элементов. Для систем реакция-диффузия (вы же их имеете в виду?) существует своё название - собственно системы реакция-диффузия.